“有些合作社的产品质量和产量都没问题，我们超市也很愿意和他们合作，可最后就是因为认证书的问题，合作没法达成。”河南大张实业有限公司蔬菜部经理田继宏表示，当下，证书难办和发票难开成了阻碍一些有资质的合作社进一步发展的瓶颈。
　　
　　田继宏告诉记者，河南大张实业有限公司曾到桂林一家合作社考察，农产品的质量经检验都没什么问题，而且产量也足，万事俱备，可是就在准备签约的时候，对方告诉自己，没法出具卫生部门和检疫部门的认证书。“超市进货是有严格程序的，没有资质认证的东西，我们验过再好也没办法进入超市。”田继宏说，这个合作结果还是泡汤了。
　　
　　不过，除了认证书难办之外，对于一些有实力的农产品生产基地或者合作社，影响合作最关键的因素是发票问题。
　　
　　河南大张实业有限公司水果部经理张军告诉记者，根据国家政策，现在蔬菜基本上都实行免税政策了，可以不用开发票。但水果方面，由于国家目前还没有免税的明文政策，对开发票的政策各地也不一，有的地方会给优惠，有的地方则税点仍然较高，这一点从一家超市采购经理的口中也得到了证实。
　　
　　该采购经理告诉记者，比如海南和云南的香蕉等水果都没办法开税务发票，而山西的苹果梨或桃子等水果，只要采购商在采购时能够提供身份证复印件等手续，国税局会给予免税的政策。不过，在广东四会的砂糖橘如果要开发票，则必须多交0.2%左右的税点，而到了河北赵州，这一税点就变成了0.6%，“这样算下来，上百万元的水果就得交好几千块钱的税，可我们生鲜水果本来就不是很挣钱。”该采购经理说。“超市的运作是非常严格的，平时进货出货的账目都需要税务发票才行，要不然没法报账。”张军说，除了超市内部要报账，超市当地的税务局在对营业额等进行计税时，一般也会要求提供水果原产地税务发票，可由于原产地水果开票难，超市经常无法提供。“如果合作社能提供税票，方便超市报账，就可以有更多的合作社和超市合作。”张军说。
　　
　　海南琼海一家合作社的吴先生也对办证难、开票难的问题反应强烈。吴先生透露，很多地方办理合作社的审批手续，甚至连开发票都得走路子，托熟人，这样也导致了合作社的很多农产品都进不了超市，尤其是大超市。田继宏反映说，因为合作社不是企业这样的法人机构，在办证和开发票方面还存在相当困难。
　　
　　因为办证难和开票难的原因，超市在寻求对接的合作社时没少费心。张军告诉记者，在谈业务的时候，经常是生意谈得一切顺利，到最后却差一张税票而不得不选择放弃。“那怎么办，广西谈不成，那我们就选择山西，山西不成就山东，总能找到开税票方便点的地方。”田继宏说。“听新闻说，合作社是可以免税的，可我经常遇到收了税却开不了票的怪事。”以上人士希望，能早日把这道障碍破除，使农超合作更顺畅。