番禺区种子站相关负责人回复称，他们无权要求穗丰公司向李明海赔偿，仅可以检查穗丰公司是否存在违规行为，如果存在则处以罚款并上缴国库。
　　
　　“说好的协商我们居然连半分钱都没得。”李明海立刻向郑康炎反映。翌日，郑康炎亲自组织了会议，摆出了双方存在的过错，认为穗丰公司因未试先推、不及时制止农户继续投入等造成农户损失，应该拿出诚意谈赔偿。穗丰公司这才答应赔偿种苗款。
　　
　　有了上级发话，身心疲惫的李明海重新看到了希望，事情开始有了转机。他认为，这要归功于媒体的真实报道和广州市种子总站给企业的压力，“报道出来后穗丰公司的人没话说，郑站长对整件事了解得更加透彻了”。
　　
　　谈判??
　　
　　三度陷僵局
　　
　　虽然穗丰公司答应赔偿，但金额仅为30万元，而李明海的要求是220万元，包括种苗款，以及由于穗丰没有及时阻止农户继续使用而造成的损失。巨大的分歧让谈判陷入僵局。
　　
　　不过，双方都不想事情继续纠缠：李明海想尽快拿到赔偿免走法律程序，而穗丰公司则受到社会舆论和广州市种子总站的压力。就这样，谈判重启。
　　
　　李明海提出，种植几百亩番木瓜的资金是几个人借回来凑一起的，80万元的贷款会把他们逼入绝境，因此赔偿款不能低于80万元。穗丰公司则表示，只能再加上维权过程中来往的费用，总共50万元。这次，双方还是未能达成共识。
　　
　　回想与穗丰公司接触的过程，李明海认为对方拥有相当数量的资产，金额不少于100万元，遂向穗丰公司表明，自己的同伴已联系担保公司并正在对穗丰公司进行资产估算。
　　
　　其后，穗丰公司将赔偿金额从50万升至65万。穗丰公司回应，这是考虑到农户确实投入了一定成本，同时助其恢复生产，更快将此次纠纷了结。双方最终达成一致，现金赔偿66万元，其中1万元为维权路费。
　　
　　至此，李明海等人终于可以回家，结束3、4个人挤一间房，吃快餐的生活。目前，穗丰公司被责令停业整改，基地种苗也被封存。
　　
　　■回应
　　
　　处理跨区纠纷
　　
　　农业部门感尴尬
　　
　　广州市种子总站副站长郑康炎：地方农业部门在处理纠纷案件时处境尴尬，由于跨部门、跨地区和执法标准差异等问题存在，在实际处理纠纷过程中有着难言之隐，并非故意推托。类似这起跨省番木瓜种苗质量纠纷，番禺区种子站和东方市农业局的权限不足，很难在短时间内给予农户李明海等人满意的答案，毕竟《种子法》不仅保护农户的利益，还有种子经营者和生产者。李明海上访东方市农业局无果后，可求助上一级部门，由海南省农业厅或者海南省种子站与广东省农业厅或者种子站沟通，委托或共同处理这起案件。
　　
　　这次，广州市种子总站执法受广东省种子站委托，配合番禺区种子站共同处理该起纠纷。郑康炎回忆，当时调解双方谈判时李明海一天一个电话，缘于他不了解职能单位的办事流程，他选择耐心聆听。