吉尔吉斯斯坦媒体报道，吉环境保护人士对吉目前在没有任何管制的情况下，随意进口转基因农产品表示担忧，并敦促政府尽快出台政策予以规范，以保护吉公民的健康和环境。
　　
　　吉政府曾于2006年起草了一份旨在管理转基因产品进口及生产的法律草案，但被议会以需改进为由驳回。虽然吉可根据有关国际条约规定，限制进口某些转基因产品，但吉政府实际上未采取任何管制措施。大量转基因种子从美国、荷兰、德国、中国等地进口，包括西瓜、卷心菜、西红柿、胡椒、黄瓜、土豆、甜菜等。
　　
　　此外，吉当地农民还担心，大量进口的廉价、美观、保质期更长的转基因产品将把他们用传统方式生产的蔬菜、水果挤出市场。有吉农民称，吉本地水果成本低，更安全，但从中国进口的转基因苹果外观更好，不知转基因为何物的老百姓宁可花更多的钱买这样的苹果。
　　
　　自上世纪90年代中期，转基因技术开始在农业中广泛使用，但关于其利弊的争论也从未停止，支持者认为，这种抗病新产品能够大大提高农产品产量，有助于减少贫困；反对方则称，转基因产品可能会扰乱人体免疫系统，造成过敏反应等失调情况，还可能通过基因污染的方式对环境造成损害，更有人担心可能会出现有机体突变或更加危险的病毒等，对此目前还缺少长期的研究数据。
　　
　　尽管如此，转基因商品的生产却在不断扩大，根据估计，全球转基因产品的年销售额约为200亿美元，但生产总量仍只占到全球食品年消费量的1%,但增速很快，主要生产国包括美国、日本、德国、法国、中国和印度。
　　
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